次氯酸鈉是常見的消毒劑，次氯酸鈉溶于水后與水反應生成次氯酸(HClO),利用次氯酸的強氧化性消毒殺菌。

其次，次氯酸在殺菌、殺病毒過程中，不僅可作用于細胞壁、病毒外殼，而且因次氯酸分子小，不帶電荷，還可滲透入菌（病毒）體內與菌（病毒）體蛋白、核酸和酶等發生氧化反應或破壞其磷酸脫氫酶，使糖代謝失調而致細胞死亡，從而殺死病原微生物。

同時，次氯酸產生出的氯離子還能顯著改變細菌和病毒體的滲透壓，使其細胞喪失活性而死亡。

影響次氯酸鈉消毒殺菌作用的因素：

PH：PH值對次氯酸鈉消毒殺菌作用影響最大。PH值愈高，在堿性環境下次氯酸鈉以次氯酸根的形態存在，其消毒殺菌作用愈弱，PH值降低，其消毒殺菌作用增強。

濃度：在PH、溫度、有機物等不變的情況下，有效氯濃度增加，殺菌作用增強。

溫度：在一定范圍內，溫度的升高能增強殺菌作用，此現象在濃度較低時較明顯。

有機物：有機物能消耗有效氯，降低其殺菌效能。

水的硬度：水中的Ca+、Mg+等離子對次氯酸鹽溶液的殺菌作用沒有任何影響。